알립니다! Brain Box와 The Open Neuroimaging Lab

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새로운 프로젝트인 The Open Neuroimaging Laboratory(오픈 뇌 영상 랩)과 BrainBox를 알리는 소식을 기쁘게 전해드립니다. 이 프로젝트는 Open Science Prize에 의해 가능했습니다.

뇌는 단순한 신체 기관이 아닙니다. 해마(hippocampus), 피질(gray matter) 및 수질(white matter)과 같이 내부 하위 구조와 함께 다양한 부분으로 이루어져 있습니다. 감지하고(perceive), 느끼고(feel), 생각하는(think) 능력을 뇌의 내부적으로 연결된 부위가 결정하게 됩니다. 그런 부위의 변이와 뇌 질환은 관련이 있습니다. 이런 뇌 부위를 다르게 매핑하는 방법으로는 MRI와 같은 방법을 통해 뇌의 이미지를 보는 것입니다. 그러나 MRI 이미지를 만드는 것으로 충분하지는 않습니다. 정확한 구조의 상세한 내용을 알기 위해서는 전문가들이 분석하고 주석을 달아야만 합니다. 일부 소프트웨어가 있어 도움을 주지만, 소프트에어의 작업을 확인하고, 실수를 수정하기 위해서는 엄청난 전문적 시간이 요구됩니다. 공개 데이터 집합(public datasets)이 매일 만들어져 이미지 데이터와 주석이 추가된 데이터집합 이 두 정보의 틈은 더 벌어지게 됩니다. 이 이유로 우리는 Open Neuroimaging Lab과 BrainBox를 만들고 있습니다! 이 도구는 과학자들을 교육하고 일반인들이 게임처럼 애플리케이션을 사용할 수 있도록 돕게 됩니다.

애플리케이션의 예:

    • 여러 조건이 어떻게 뇌 구조를 변화하는지 이해하기 위해 자폐를 가진 사람들의 뇌를 매핑합니다.
    • 뇌에 있는 종양이나 장애의 위치를 찾습니다.
    • 종(species)별로 뇌가 어떻게 다른지를 관찰하여 사람의 뇌와 동물의 뇌의 연관성을 찾고, 이를 통해 크라우드 소싱 큐레이션(*)을 통해 얻은 데이터 질을 향상하고 이런 데이터를 사용하여 자동화 처리를 발전하는 데 도움을 받게 됩니다.

이것은 시작에 불과합니다. 세계에 있는 연구원들과 신경과학 팬들에게 협동의 neuroimaging(뇌 영상) 도구를 제공하여 오픈 사이언스를 발전시켜 나가는 것이 무척 신나고 기쁩니다. BrainBox는 연구원들이 이미 사용하고 있습니다. 여러분이 참여하기 원하면 연락 주세요!

(* Curation: 많은 자료 중에 유용하다가 판단되는 것을 목적에 따라 선별하고 구성하는 작업)

사용 방법

The Open Neuroimaging Laboratory(ONL)은 협력을 통한 클라우드 소싱 분석을 위한 온라인 플랫폼입니다. BrainBox를 통한 시민 과학자들의 크라우드 소싱을 통한 분석은 연구원들을 지원합니다. 그리고, ONL은 연구원들을 위협력 분석 도구의 역할을 합니다.

ONL은 쉽고 빠른 방법으로 데이터 공유를 권장하여, 공유된 데이터의 카탈로그를 만들고 분류(curate, 자세한 의미는 위 큐레이션*의 설명을 참고)하는 능력을 갖추게 됩니다. 웹 브라우저 애플리케이션인 BrainBox는 사용 기기와 상관없이 사람들이 각자 원격으로 함께 일하는 것을 가능하게 합니다. 그리고 데이터세트를 다운받거나 소프트웨어를 설치할 필요 없이 어떤 기기에서든 연구원들 간의 실시간 사회적 커뮤니케이션을 가능하게 합니다.

ONL과 BrainBox는 데이터 가치를 높여주게 되며, 목록을 만듦으로 더 쉽게 찾고 작업할 수 있는 데이터베이스를 갖게 될 것입니다. ONL과 BrainBox는 재사용을 위해 주석과 분석 결과를 저장합니다.

다른 종의 동물들, 다양한 임상 인구, 그리고 특정 개개인으로부터 뇌 이미지를 얻게 됩니다.

Open Science Prize Competition(오픈 사이언스 대회) 1단계에 대한 설명과 BrainBox 팀을 자랑스럽게 소개합니다.

  • Satrajit Ghosh (MIT)
  • Roberto Toro (Institut Pasteur, EU PI)
  • Katja Heuer (Max Planck Institute)
  • Arno Klein
  • Wired Differently squad
    • Amy Robinson Sterling (Executive Director, USA PI)
    • Alex Norton (Interaction Designer)
    • Chris Jordan and Will Silversmith (Developers)

여섯 팀이 선택되어 자신들의 아이디어를 프로토타입으로 발전시키고 Open Science Prize 상금 23만 불을 놓고 경쟁합니다. Open Science Prize는 글로벌 과학 대회로 과학과 연구에서 얻어진 결과는 대중이 접근할 수 있게 됩니다. 미국 Washington, D.C.에서 열렸던 제7회 Health Datapalooza Conference에서 발표된 최종 경쟁자들은 45개국에서 혁신적인 450명으로 구성된 다국적이고 융합적인 96개 팀이 선택되었습니다. the National Institutes of Health와 the Wellcome Trust의 합작과 Howard Hughes Medical Institute의 추가 재정 지원으로 최근에 시작한 이 글로벌 시상 대회에 처음 선택된 최종 경쟁자들입니다.

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